Запопан муниципалитетіндегі Гвадалахара қаласына жақын салтанатты орталық болған Истепетенің археологиялық қалдықтары және Атемажак аңғарындағы жиырмадан астам шахталы қабірлердің соңғы кездесулері классикалық кезеңде маңызды кәсіптердің болғандығы туралы қорытынды жасауға мүмкіндік береді (200 BC-650 AD)
Жаулап алудан біраз бұрын, аңғарда 1530 жылы Нуньо Бельтран де Гузманның үлкен қарсылығынсыз ұсынған Тоналланның доминонына тәуелді шағын ауылдарда жиналған Кока мен Текуекстің топтары қоныстанды.
Келесі жылдың соңында Гусман солтүстікке қарай жаулап алуды қолға алып, Хуан де Онатеге Сантьяго өзенінің шатқалынан өтуді тапсырды және мүмкіндігінше, бірақ сақтықпен испан халқын таппай, өзін-өзі көрсетпеді. Осылайша 1532 жылы 5 қаңтарда Нокистлан маңында, қазіргі Сакатекаста Гвадалахара құрылды.
Қоныс аударушыларға қолайсыз жағдайлар бұл қаланың Тоналаға ауысуына себеп болды, бірақ ол жерде ұзаққа созылмады және испандықтар көп ұзамай Тлакотанға қоныстанды, олар 1541 жылға дейін қалды. Микстон соғысы деген атпен танымал болған какканалардың бүлігі. бұл Испанияның доминонына үлкен қауіп төндірді, ол Гвадалахара маңына дейін келді. Вицерой Антонио де Мендоса бастаған қуатты армия «от пен қанмен» басқан көтеріліспен қала бейбітшілікке қол жеткізді, бірақ жергілікті еңбексіз қалды, сондықтан оны іздеп, олар халықты қоныс аударуға шешім қабылдады. 1542 жылы 14 ақпанда соңғы және түпкілікті іргетасы қаланған Валле-де-Атемаяк. Кейінірек, үш жыл бұрын король оған қаланың дәрежесі мен артықшылықтарын бергені туралы жаңалық расталды.
1546 жылы Рим Папасы Павел III Нуева Галисия епископиясын құрды және 1548 жылы аттас Аудиенсия құрылды; Екі юрисдикцияның штаб-пәтері бастапқыда Компостелада, Тепикте болды, 1560 жылы оны Гвадалахараға өзгерту бұйырылды, осылайша оны Гуадалахара Аудиенсиясы деп атаған кең территорияның сот басшысы етіп жасады, Нуэва Галисия Корольдігінің астанасы және орын. Епископтық кеңес. Испандықтардың әрқайсысы Сан-Фернандо алаңынан шахмат тақтасы тәрізді тартылғандықтан және әдеттегідей, Мексикальцинго, Аналко және Мескутанның жергілікті аудандары жоспардан тыс қалды. Евангелизация процесін францискалықтар бастады, содан кейін Августиналықтар мен иезуиттер.
Бірте-бірте қиындықтар мен сәтсіздіктермен, сонымен бірге табыстармен Гвадалахара өсіп, өзін экономикалық және қуат орталығы ретінде танытты, сондықтан 18 ғасырдың ортасында Гвадалахарадан шыққан ауқатты адамдардың көп бөлігі Нуэва Галисияны Нуэва Визкаямен бірге шетелдік иелікті біріктіруді қалады. Жаңа Испанияға дейін, 1786 жылғы аумақтық құрылымды өзгерткен саяси-әкімшілік реформалар есебінен қол жеткізілмеген, бүкіл вице-мэрлікті 12 муниципалитетке бөлген, олардың бірі Гвадалахара болды.
Колония кезінде, әсіресе 18 ғасырда, экономикалық өрлеу сәулеттік, мәдени және көркем мұра қалдырды, оның айғақтары әлі күнге дейін бүкіл қалада қалады.
Жаңа Испания аумағында өткен тәуелсіздік идеялары Джалискоға еніп, тәуелсіздік соғысы басталған кезде муниципалитеттің әртүрлі бөліктерінде көтерілістер болды.
1810 жылы 26 қарашада Дон Мигель Идальго үлкен әскерді басқарып, Гвадалахараға кіріп, оны қаланы аз уақыт бұрын алған Хосе Антонио Торрес қабылдады. Идальго мұнда құлдықты, мөртабан қағаздар мен алькабалаларды жою туралы жарлық шығарды және көтерілісшілердің El Despertador Americano газетінің шығуына демеушілік жасады.
1811 жылы 17 қаңтарда көтерілісшілер Кальдерон көпірінде талқандалды және Каллехияның роялистік әскерлері Госалонахараны қалпына келтірді, ол епископ Кабаньяспен бірге бүліктің кез-келген өршуін жойды.
1821 жылы тәуелсіздік жарияланып, еркін және егеменді Джалиско мемлекеті құрылып, Гвадалахара штаттың астанасы және билік орны ретінде қалды.
ХІХ ғасырда бүкіл елде орын алған тұрақсыздық, шетелдік шапқыншылықтың әсерінен шиеленісіп, оны қиындатты, бірақ мемлекетке, әсіресе оның астанасына әр түрлі тәртіппен дамуға кедергі бола алмады. Нақты мысалдар: ғасырдың екінші ширегінде Мемлекеттік ғылымдар институтын құру; Көркемөнер және қолөнер мектебінің, Ботаникалық бақтың, Пенитенциарлық және Вифлеем Пантеонының құрылысы, сондай-ақ алғашқы зауыттардың ашылуы.
Сексенінші жылдардың басында жануарларды тартуға арналған қалалық трамвайлар пайда болды, электр жарығы 1884 жылы орнатылды, 1888 жылы Мексикада бірінші және 1909 жылы Манзанилода теміржол пайда болды. Тоқсаныншы жылдары Дон Мариано Барсена астрономиялық обсерваторияны құрды. өндірістік мұражай.
Төңкеріс кезінде Гвадалахарада Диаз диктатурасына қарсы көтеріліс болды, мысалы, жұмысшылардың ереуілдері және студенттердің наразылығы, Мадероны тіпті 1909 және 1910 жылдары үлкен жанашырлықпен қабылдады. Алайда, кейіннен ешқандай соғысқан оқиғалар болған жоқ. Екінші жағынан, Гвадалахараның астанасы 1930 жылы Кристерос соғысында бұзылған бейбітшілік келісілгеннен кейін аяқталған тоқырауға ұшырады.
Отаршылдық қалаларын да қараңыз: Гвадалахара, Джалиско
